台灣水域館簡介
擁有全世界完整模擬台灣本土水域生態，藉著小水滴的旅行，訴說台灣河川到海洋生態；可看到高山溪流、河流、水庫、河口區、潮間帶等台灣獨特的水生生態。其中的大洋池展示缸是全台最大(寬22×長32m)、最大水量(一百萬加崙)的缸體，也是大型洋流迴流生物的所在地，展示包括鯊魚、魟魚、鰹魚及石斑等數十種大型魚類。其中觸摸池設施，還可以親手觸摸潮間帶生物，與海參、海膽、海星等水生生物，做最親密接觸。
珊瑚王國館簡介
入口以瑰麗的珊瑚與繽紛的魚群帶領下，繞過圓柱型水槽緩步下潛，漸漸進入長達84公尺的海底隧道，穿梭於巨大型水槽中，親自體驗絢爛多采、生氣盎然的珊瑚世界，昂頭觀望魚群漫遊，猶如置身驚喜無限的海底世界。另外來到白鯨隧道區，還可看到小白鯨可愛又討喜的模樣，與到訪的遊客們相見歡。
世界水域館簡介
透過先端科技的整合，運用3D立體互動動畫，介紹涵蓋全球水域，展示古代海洋、海藻森林、深海水域、極地水域等四大主題，使到訪的遊客們在虛擬和實體結合的情境營造中，達到寓教於樂的參觀體驗。
餵食生態解說，趣味學海洋知識
館內每日定時定點生態解說場次，如台灣水域館─大洋池餵食解說；珊瑚王國館─與魚共舞；世界水域館─企鵝、海藻森林、海豹、海鸚鵡餵食解說，讓民眾更認識海洋世界的奧妙之處。除了不同主題的定時定點的解說外，更有提供中英文預約導覽服務，以多元方式推廣屬於台灣珍貴的海洋生物多樣化。
